Az Európa Központot 1996-ban alapította az PTE Szenátusa rektor-közvetlen szervezeti egységként, intézeti jogállással. 1998-tól – Magyarország Európai Unióhoz való csatlakozási tárgyalásainak megkezdése idején – az országban több hasonló, közösségi költésgvetésből pályázatok útján finanszírozott központ kezdhette meg tevékenységét, főként az Európai Unióvaló összefüggő tanulmányok szervezése, képzések fenntartása céljából. A pécsi egyetemi integráció szervezeti változtatásainak során az Európa Központ 2000-ben az Állam- és Jogtudományi Kar szervezeti egységévé vált, továbbra is intézeti jelleggel.
Az Európa Központ a PTE ÁJK szervezeti egységeként jelenleg a Dél-Dunántúli Regionális Könyvtár és Tudásközpont épületében végzi tevékenységét. Az Európa Központ rendeltetése, hogy európai uniós témakörök kapcsán konferenciákat, kerekasztal-beszélgetéseket, rövid továbbképzéseket, tudományos előadássorozatokat, nyári egyetemeket szervezzen, valamint tudományos kutatómunkát és publikációs tevékenységet végezzen. A Központ rendszeresen vesz részt európai uniós és hazai pályázati projektekben. A Központ kiterjedt szakmai hálózattal rendelkezik, mind az elméleti jogtudomány, mind a joggyakorlat terén kiváló kapcsolatokat tart fenn partnereivel. A Központ adja ki a Pécs Journal of International and European Law elnevezésű angol nyelvű elektronikus szakfolyóiratot, valamint (a Publikon Kiadóval együttműködésben) a Studia Europaea c. könyvsorozatot.